Definición
Una relación entre genes o elementos genéticos en la que la homología surge porque una secuencia ha sido transferida entre organismos o linajes por mecanismos horizontales (no verticales), produciendo similitud entre taxones que de otro modo no estarían relacionados.

Principio

Principio
La transferencia horizontal de genes (THG) u otros intercambios genéticos no verticales pueden mover un elemento genético desde un donante a una línea receptora; el elemento transferido conserva su ascendencia, pero su presencia en el receptor crea similitud homóloga que no refleja la descendencia vertical estándar.

Demostración

Demostración
Los genes de resistencia a antibióticos transportados en plásmidos que se mueven entre especies bacterianas son xenólogos: el mismo gen de resistencia aparece en cepas distantes debido al intercambio en lugar de la herencia de un ancestro común.

Aplicación incorrecta

Aplicación incorrecta
Interpretar secuencias compartidas como xenólogos cuando en realidad resultan de contaminación, evolución convergente o sorting incompleto de linajes; o tratar cualquier similitud entre especies como xenología sin evidencia de transferencia.

Consecuencia

Consecuencia
Reconocer la xenología aclara los orígenes de genomas mosaicos, explica la rápida propagación de rasgos adaptativos entre taxones y altera la señal filogenética en árboles génicos frente a árboles de especies.

Inversión

Inversión
Herencia vertical estricta (ortología) — similitud causada por descendencia a través de eventos de especiación en vez de transferencia lateral.

Límite

Límite
Se refiere específicamente a relaciones homólogas creadas por transferencia horizontal o intercambio no vertical; excluye paralogía (duplicación) y similitud que surge únicamente por ascendencia mediante especiación. Existe ambigüedad cuando la transferencia ocurrió antes de especiaciones subsecuentes, creando patrones complejos.

Tensión semántica

Tensión semántica
Tensión con ortología y paralogía cuando las historias incluyen duplicación, especiación y transferencia; también compite con descripciones informales que confunden elementos móviles compartidos con verdadera xenología sin rastrear eventos de transferencia.

Síntesis

Síntesis
La xenología identifica material genético homólogo que entró en un linaje mediante transferencia horizontal; reconocer correctamente a los xenólogos es esencial para reconstruir la historia génica y comprender cómo los rasgos atraviesan límites de especies.